Μελέτες (Friesen & Innis, 2006) έχουν δείξει ότι τα τρανς λιπαρά οξέα αυξάνουν σημαντικά τις φλεγμονώδεις αντιδράσεις και προκαλούν δυσμενείς επιπτώσεις στην ανάπτυξη των παιδιών. Τα παιδιά των οποίων οι μητέρες είχαν αλλεργίες ή των οποίων το γάλα περιείχε υψηλά επίπεδα τρανς λιπαρών οξέων αναπτύσσουν επίσης αλλεργίες. Τα τρανς λιπαρά οξέα στο μητρικό γάλα έχουν συνδεθεί με την ανάπτυξη αλλεργικών συμπτωμάτων στα παιδιά και μπορούν να επηρεάσουν τον μεταβολισμό των πολυακόρεστων λιπαρών οξέων. Η διαταραγμένη σύνθεση των πολυακόρεστων λιπαρών οξέων μπορεί να επηρεάσει αρνητικά την ανάπτυξη του βρέφους.
Πρόσφατες μελέτες έχουν δείξει ότι η αύξηση, η ανάπτυξη, το βάρος και το ύψος του εμβρύου στη μήτρα, καθώς και η διάρκεια της εγκυμοσύνης, επηρεάζονται έντονα από τα τρανς λιπαρά οξέα, τα οποία εισέρχονται στο έμβρυο μέσω του πλακούντα και της κυκλοφορίας του αίματος της μητέρας. Μπορούν να επηρεάσουν την ανάπτυξη χρόνιων ασθενειών που σχετίζονται με τη διατροφή, καθώς τα παιδιά μεγαλώνουν, ωριμάζουν και γίνονται ενήλικες. Τα τρανς λιπαρά οξέα απορροφώνται εύκολα και επομένως περνούν εύκολα στον πλακούντα, στους ιστούς του εμβρύου και στο μητρικό γάλα. Το μητρικό γάλα μπορεί να περιέχει βιομηχανικά παραγόμενα τρανς λιπαρά οξέα, τα οποία μπορούν να επηρεάσουν την περιεκτικότητα του σε απαραίτητα λιπαρά οξέα. Αυτό μπορεί να έχει σημαντικές επιπτώσεις στην ανάπτυξη του παιδιού. Τα λιπαρά οξέα που υπάρχουν στο μητρικό γάλα μπορούν να τροποποιηθούν με την βελτίωση της διατροφής της μητέρας (Chávez-Servín et al., 2022).
Οι διατροφολόγοι και οι παιδίατροι θα πρέπει να προειδοποιούν τους γονείς για τις επιπτώσεις των τρανς λιπαρών στην υγεία των παιδιών σε νεαρή ηλικία και να τους ενθαρρύνουν να ελαχιστοποιούν την κατανάλωση ζαχαρωδών, fast food, χάμπουργκερ, τηγανιτές πατάτες και άλλων προϊόντων με υψηλά επίπεδα τρανς λιπαρών οξέων. Έχει επίσης διαπιστωθεί η επίδραση των τρανς λιπαρών οξέων στην ανάπτυξη αλλεργιών και εκζεμάτων σε παιδιά ηλικίας 13-14 ετών (Semma, 2002).