Badania (Friesen & Innis, 2006) wykazały, że kwasy tłuszczowe trans znacznie zwiększają reakcje zapalne i powodują niekorzystny wpływ na wzrost i rozwój dzieci. U dzieci, których matki miały alergie lub których mleko zawierało wysoki poziom kwasów tłuszczowych trans, również rozwijają się alergie. Kwasy tłuszczowe trans w mleku matki są związane z rozwojem objawów alergicznych u dzieci i mogą zakłócać metabolizm wielonienasyconych kwasów tłuszczowych. Upośledzona synteza wielonienasyconych kwasów tłuszczowych może niekorzystnie wpływać na wzrost niemowląt.
Ostatnie badania wykazały, że na wzrost, rozwój, wagę i wzrost płodu w łonie matki, a także długość ciąży, silnie wpływają kwasy tłuszczowe trans, które dostają się do płodu przez łożysko i krwioobieg matki. Mogą wpływać na rozwój chorób przewlekłych związanych z dietą, gdy dzieci rosną, dojrzewają i stają się dorosłe. Kwasy tłuszczowe trans są łatwo wchłaniane i dlatego łatwo przenikają do łożyska, tkanek płodu i mleka matki. Mleko matki może zawierać produkowane przemysłowo kwasy tłuszczowe trans (TFA), które mogą wpływać na zawartość niezbędnych kwasów tłuszczowych (EFA). Może to mieć znaczący wpływ na rozwój dziecka. Kwasy tłuszczowe obecne w mleku matki można modyfikować poprzez dostosowanie diety matki (Chávez ‑ Servín i in., 2022).
Dietetycy i pediatrzy powinni ostrzegać rodziców o wpływie TFA na zdrowie dzieci w młodym wieku i zachęcać je do minimalizowania spożycia słodyczy, fast foodów, hamburgerów, frytek i innych produktów o wysokim poziomie kwasów tłuszczowych trans. Ustalono również wpływ kwasów tłuszczowych trans na rozwój alergii i egzemy u dzieci w wieku 13-14 lat (Semma, 2002).